В IX в. н. э. территория Джибути попала под власть мусульманского королевства Ифат и входила в его состав до XIV в. Жители этого королевства, которое простиралось на запад от Индийского океана до эфиопской провинции Шоу, говорили на семитском языке. Его столица находилась на территории нынешнего Сомали, в г. Зейла, который благодаря своему морскому порту привлекал индийских и египетских купцов.
Попытки распространения ислама на соседние эфиопские земли встретили противодействие со стороны их населения. На религиозпой основе стало усиливаться существовавшее веками соперничество между мусульманами-кочевниками и более богатыми жителями Эфиопского нагорья, исповедовавшими древнее христианство. Стремясь навязать эфиопам мусульманскую веру, это королевство начиная с XIII в. вело непрерывные войны с соседней Эфиопией, но победы не добилось.
Описывая в XIV в. жизнь народов Африканского Рога, арабский путешественник Ибн-Ватутах говорил о Зейле как о столице государства Берберии, территория которого простиралась от Зеплы до Могадишо. Это название сохранил до наших дней сомалийский порт Бербера, а египтяне и сейчас часто называют сомалийцев барбаруи, т. е. жителями Берберы.