В прибрежных водах водятся не только декоративные, но и промысловые рыбы: тунец, барракуда, мурена, вьюн, скат манта, меру, каранга и др. Многие из вылавливаемых рыб даже не имеют своего названия. Среди них много ядовитых, и в пищу их употреблять ни в коем случае нельзя. В открытом море и в Баб-эль-Мандебском проливе водятся акулы: голубая, леопардовая, тигровая и песчаная, кормилица и молот. Время от времени в водах появляются дюгони, или морские коровы. У самого побережья множество крабов. Совершенно свободно выходя на берег, они в случае опасности удивительно быстро убегают боком в море или же забиваются в вырытые ими в песке норы. Рыбаки вылавливают много креветок и лангустов.
К сожалению, в последние годы морская фауна подвергается массовому истреблению. Особый интерес для браконьеров представляют морские черепахи. Несмотря на то что охота на этих животных давно запрещена, блюда из черепашьего мяса можно отведать почти в любом ресторане, а на базаре всегда имеются в продаже черепашьи панцири. Начиная с 1985 г. правительством предпринимаются меры по сохранению морских богатств. В соответствии с декретом президента со дна залива не разрешается добывать кораллы, запрещена подводная охота. Законом охраняются такие редкие виды морской фауны, как кашалоты, дельфины. Строго регламептироваиа рыбная ловля, заниматься ею могут лишь официально зарегистрированные рыбаки, имеющие джибутийское гражданство, и рыболовецкие кооперативы. Рыбаки-любители должны приобретать лицензию. Улов строго ограничен и не должен превышать 10 рыб в день независимо от их размеров. Определенные места Таджурского залива превращены в заповедные зоны.