Дожди в Джибути редки и нерегулярны. В среднем на ее территории отмечается 26—30 дождливых дней в году. В большинстве своем они приходятся на март и ноябрь. Количество осадков зависит от географического положения района и его высоты над уровнем моря. В обычный климатический год над большей частью территории выпадает 100—150 мм осадков. В засушливые годы их количество не превышает 50 мм. За последние 55 лет максимальный уровень осадков достигал 300 мм в год, более стабильные осадки, т. е. в среднем 500 мм в год, наблюдаются в массивах Года и Мабла.
Во время дождей быстро наполняются водой пересохшие русла рек, или, как их здесь называют, вади. Увеличивается количество воды в колодцах. На полях, в долинах и горах появляется трава, более зелеными становятся деревья. Дожди радуют джибутийцев, особенно скотоводов и земледельцев. Но случаются и внезапные ливни, когда в течение только одних суток на землю выпадает свыше 100 мм осадков. Они, правда, редки. Всего три-четыре раза в год. В западных районах такие ливни, как правило, бывают в феврале—марте, а в восточных — в октябре—ноябре. Продолжаясь в среднем от одного до трех дней, они выбрасывают на землю громадное количество воды, достигающее порой 3,6 млн м.куб. Скатываясь с гор, бурные потоки воды быстро заполняют вади, затопляют дороги, уносят с собой все, что встречается па пути. Очень часто можно видеть, как в таком потоке изо всех сил барахтается овца или коза, а люди не отваживаются прийти на помощь, опасаясь, что этот поток унесет и их. Парадокс, но страна, постоянно страдающая от засухи, подвергается и наводнениям, иногда наносящим большой урон национальной экономике.